Kaip ir bet koks kitas natūralioje aplinkoje atsiradęs techninis įrenginys vėjo elektrinė gali sukelti tam tikrą poveikį augalijai ir gyvūnijai. Svarbu nustatyti tokio galimo poveikio atsiradimą dar projekto rengimo metu bei numatyti jo mažinimo priemones. Tai numatoma detaliojo planavimo procedūrose atliekant poveikio aplinkai vertinimo atranką arba, prireikus, pilną poveikio aplinkai vertinimą.
Ilgamečiai moksliniai tyrimai rodo, kad vėjo energetika neįtakoja naminių ir laukinių gyvūnų, jūroje sukuria gyvenimui tinkamus dirbtinus rifus žuvims ir kitiems jūros gyviams. Nuodugniai išnagrinėjus galimą poveiki paukščiams nustatyta, kad 17-35 apsisukimų per minutę greičiu besisukančios vėjo elektrinės mentės nesukelia pavojaus praskrendantiems paukščiams.
Ypatingas dėmesys atkreipiamas į vėjo elektrinių galimą poveikį gyvūnijai ir augmenijai saugomose teritorijose – nacionaliniuose parkuose, rezervatuose, draustiniuose ir NATURA 2000 teritorijose. Įrengiant vėjo elektrines tokioje jautrioje aplinkoje dažniausiai atliekama pilna poveikio aplinkai vertinimo procedūra.
Visais atvejais vėjo energetika – tai draugiška aplinkai, jos neteršianti energetikos rūšis skirta mažinti anglies dvideginio emisiją ir mažinti šiltnamio efektą.
